MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 5601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021081	AGC	2	6	967491	967496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_021081	AGG	2	6	967505	967510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_021081	TGG	2	6	972981	972986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_021081	GTT	2	6	973093	973098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_021081	AATA	2	8	973110	973117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_021081	AATG	2	8	973132	973139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_021081	AGG	2	6	973182	973187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_021081	GAT	2	6	978079	978084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_021081	CCA	2	6	978097	978102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2010	NC_021081	TAAGG	2	10	978104	978113	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_021081	CAGC	2	8	978143	978150	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2012	NC_021081	AGC	2	6	978169	978174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_021081	CGG	2	6	982227	982232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_021081	GGAT	2	8	982245	982252	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_021081	CTGG	2	8	984740	984747	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2016	NC_021081	GAT	2	6	984753	984758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_021081	TGA	2	6	984785	984790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_021081	GCTT	2	8	984791	984798	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2019	NC_021081	TCT	2	6	987334	987339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_021081	C	6	6	987376	987381	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2021	NC_021081	TCC	2	6	987390	987395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2022	NC_021081	GAG	2	6	987526	987531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_021081	TGC	2	6	987535	987540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NC_021081	CAC	2	6	988283	988288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2025	NC_021081	GC	3	6	988301	988306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2026	NC_021081	TGC	2	6	988317	988322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_021081	G	6	6	988444	988449	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2028	NC_021081	TCA	2	6	988563	988568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2029	NC_021081	GGTA	2	8	991766	991773	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_021081	AGC	2	6	991774	991779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2031	NC_021081	GGTT	2	8	995027	995034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_021081	GC	4	8	996487	996494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2033	NC_021081	C	6	6	997873	997878	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2034	NC_021081	ACA	2	6	999403	999408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2035	NC_021081	CA	3	6	999448	999453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2036	NC_021081	CA	3	6	1001353	1001358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2037	NC_021081	C	6	6	1001366	1001371	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2038	NC_021081	T	6	6	1003300	1003305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_021081	GCCC	2	8	1003331	1003338	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2040	NC_021081	CCG	2	6	1004214	1004219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2041	NC_021081	TCC	2	6	1005506	1005511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2042	NC_021081	GAC	2	6	1005529	1005534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_021081	CCGG	2	8	1005597	1005604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2044	NC_021081	CGGC	2	8	1008906	1008913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2045	NC_021081	C	6	6	1008928	1008933	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2046	NC_021081	GGC	2	6	1008944	1008949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2047	NC_021081	GCC	2	6	1008973	1008978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2048	NC_021081	GTT	2	6	1008989	1008994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_021081	GGGGA	2	10	1008995	1009004	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_021081	ATTGT	2	10	1011664	1011673	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_021081	A	7	7	1011697	1011703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_021081	GGAG	2	8	1011877	1011884	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_021081	AC	3	6	1012901	1012906	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2054	NC_021081	AACC	2	8	1012951	1012958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2055	NC_021081	TGA	2	6	1012975	1012980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_021081	T	6	6	1012984	1012989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_021081	GGT	2	6	1012991	1012996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_021081	CCG	2	6	1013151	1013156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2059	NC_021081	CCCA	2	8	1013199	1013206	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2060	NC_021081	CCCA	2	8	1013282	1013289	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2061	NC_021081	CGG	2	6	1014827	1014832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2062	NC_021081	TAG	2	6	1014847	1014852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_021081	GT	3	6	1016270	1016275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_021081	CTT	2	6	1018700	1018705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2065	NC_021081	CAGG	2	8	1018721	1018728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2066	NC_021081	CGTG	2	8	1018749	1018756	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2067	NC_021081	GCT	2	6	1018757	1018762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2068	NC_021081	GAG	2	6	1018884	1018889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_021081	CTGG	2	8	1019014	1019021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2070	NC_021081	GCA	2	6	1019166	1019171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2072	NC_021081	A	7	7	1019221	1019227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_021081	GT	3	6	1019242	1019247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_021081	CCG	2	6	1021164	1021169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2077	NC_021081	AAT	2	6	1026490	1026495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2082	NC_021081	CTTT	2	8	1029435	1029442	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2083	NC_021081	GGTG	2	8	1030103	1030110	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2084	NC_021081	GCCG	2	8	1030168	1030175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2085	NC_021081	TGG	2	6	1030773	1030778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2089	NC_021081	CAAC	2	8	1038233	1038240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2090	NC_021081	TTG	2	6	1038337	1038342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2092	NC_021081	GC	3	6	1041238	1041243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2093	NC_021081	CAG	2	6	1041970	1041975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2096	NC_021081	AGGAT	2	10	1044358	1044367	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2097	NC_021081	CGAA	2	8	1045037	1045044	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2099	NC_021081	TGA	2	6	1045061	1045066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2101	NC_021081	ACC	2	6	1045913	1045918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2102	NC_021081	TCCAG	2	10	1045922	1045931	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2103	NC_021081	A	6	6	1045937	1045942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2104	NC_021081	GGCT	2	8	1046006	1046013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2105	NC_021081	CGG	2	6	1046048	1046053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2106	NC_021081	GTTG	2	8	1050450	1050457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2111	NC_021081	GTT	2	6	1055076	1055081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2115	NC_021081	GTA	2	6	1056824	1056829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2116	NC_021081	GTC	2	6	1056902	1056907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2117	NC_021081	AGG	2	6	1056941	1056946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_021081	AG	3	6	1056956	1056961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2119	NC_021081	GGC	2	6	1056981	1056986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2120	NC_021081	G	6	6	1058192	1058197	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_021081	GA	3	6	1058210	1058215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_021081	C	6	6	1058229	1058234	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2123	NC_021081	CGG	2	6	1059332	1059337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2124	NC_021081	C	6	6	1059376	1059381	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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2127	NC_021081	CGG	2	6	1063557	1063562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2128	NC_021081	TAGCC	2	10	1064616	1064625	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2129	NC_021081	CGGG	2	8	1065276	1065283	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2130	NC_021081	AT	3	6	1066409	1066414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_021081	GAT	2	6	1066521	1066526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2132	NC_021081	ATC	2	6	1068381	1068386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2134	NC_021081	CCT	2	6	1070228	1070233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2261	NC_021081	CTTGT	2	10	1161028	1161037	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2262	NC_021081	TTGC	2	8	1161107	1161114	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2263	NC_021081	TGGG	2	8	1161746	1161753	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2264	NC_021081	GCT	2	6	1161758	1161763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2266	NC_021081	GTAGG	2	10	1164003	1164012	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2267	NC_021081	CGA	2	6	1165237	1165242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2268	NC_021081	TCCG	2	8	1165311	1165318	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2269	NC_021081	CCCGC	2	10	1165367	1165376	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2270	NC_021081	GGCGG	2	10	1165380	1165389	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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2389	NC_021081	GCC	2	6	1183535	1183540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2390	NC_021081	CTGGG	2	10	1183559	1183568	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2391	NC_021081	CAAGAA	2	12	1183576	1183587	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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2396	NC_021081	GCT	2	6	1183774	1183779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2429	NC_021081	CA	3	6	1212144	1212149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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